建武十年(34年)，大司空李通罢官，以马成代理大司空事，居大司空府如实职办事，数月之后复拜扬武将军。

建武十一年(35年)夏，西羌各族数万人，屯聚攻击掠夺，拒守浩亹隘。刘秀派遣马援、马成发起攻击。羌兵大溃，共斩首千余级。

建武十一年(35年)，马成与盖延随来歙进攻割据四川的公孙述，大败公孙述的部将王元、环安于河池、下辩，陷之，乘胜进兵。后因来歙遇刺退兵。

北拒匈奴

建武十四年(38年)，马成屯兵常山、中山以警备北部边疆，并领建义大将军朱祐所部。

建武十五年(39年)，扬武将军马成﹑捕虏将军马武随大司马吴汉北击匈奴，徙鴈门﹑代郡﹑上谷等地的官吏百姓六万余人，安置在居庸﹑常山关以东地区。

骠骑大将军杜茂因指使军吏杀人，免职。马成又代骠骑大将军杜茂建筑工事，自西河至渭桥，自河上至安邑，自太原至井陉，自中山至邺，都建筑堡垒，起烽火，十里建一个了望哨所。在职事五六年，帝以马成勤劳，征召回京。边疆人士多有上书求其回边的，帝因此再派遣马成还屯。等到匈奴南单于保塞自安，北方安宁无事，拜马成为中山太守，呈上将军印绶，仍领屯兵如故。

平夷无功

光武中兴以后，武陵蛮夷特别强盛。建武二十三年(47年)，精夫相单程等人凭藉蛮夷的地形险要，大肆进攻郡县。

建武二十四年(48年)，相单程等人向下游攻打临沅，朝廷派谒者李嵩、中山太守马成攻打相单程，不能取胜。

马成因此次率军南击武奚谷蛮贼，未建军功，就呈上太守印绶。

建武二十七年(51年)，定封全椒侯，就国。

建武三十二年(56年)去世。