但是由于他所研究的这个学问，也就是所谓“经学”，本身就是和政治脱不了干系的，再加上他作为名儒和经学大师的名声，就使得他最终不得不被卷入政治漩涡。到东汉灵帝后期，“党锢”已解，而郑玄声名却大振，便自然成为各路军事豪强想要抢夺的人物，因为他们都想要拉拢这位大儒来为自己站台，以证明自己的政治合法性。

据《汉书·郑玄传》记载，先是大将军何进要征辟郑玄出来做官。郑玄不得已只好去。虽然受到何进的礼遇，但郑玄不肯受朝服，而以幅巾见，并且只住了一个晚上就遛了。然后是将军袁隗上表推荐郑玄为侍中，郑玄以老父去世、丧服在身为由推辞了。

董卓废少帝刘辨立献帝刘协后，以公车征召郑玄等，郑玄没有响应[7]。董卓迁都长安后，朝廷公卿举荐郑玄为赵相，但郑玄以道路因战乱被阻隔为由未赴任。当时其他一些地方政要，也对郑玄给予极高的礼遇，如北海相孔融在郑玄的故乡高密县特立一“郑公乡”，并且建造过一座“通德门”以表彰他的德行。

徐州牧陶谦也在郑玄逃避黄巾之乱来到徐州时，给郑以热情接待，待之以师友之礼。而在陶谦死后，刘备以平原相领徐州牧，也与郑玄过从甚密，形同师友[8]。甚至连当时造反起义的黄巾军，对郑玄也是礼遇有加。据郑玄本传记载，当郑玄在建安元年从徐州返回高密县的途中，遭遇一伙黄巾军，有数万人。

为首的得知遇到的是郑大师，居然立即下马叩拜，并且传令下属，任