从万历初期的时候，兵部侍郎汪道昆前去巡视边境，李成梁献上建议将孤山堡移建到张其哈剌佃，险山堡迁移到宽佃，沿江新安四堡迁移到长佃、长岭诸处，仍以孤山、险山二参将驻守，可以开辟疆土七八百里，可以大大扩张耕牧之利。汪道昆上报明廷，明廷认为可以实行。

从此这里的人口生计日益繁荣，增至六万四千余户。到了万历三十四年(1606年)，李成梁以那里孤悬于外很难守住为由，舍弃了辽左六堡，将那里的六万四千余户居民迁移到内地，那些居民依恋家室不想离开，李成梁就以大军驱赶他们，造成很多流血事件，死者很多。为此，李成梁大受朝野谴责。

万历三十六年(1608年)又被劾罢，熊廷弼守辽东时，指出李成梁罪可至死。万历四十三年(1615年)李成梁卒於北京，葬仰山之北(今北京附近)。李成梁死后三年，万历四十六年(1618年)，努尔哈赤诏告对明朝的“七大恨”檄文，正式对明廷宣战。