文帝宽宥

大统三年(537年)秋，独孤信到达长安。他认为自己的行为有损国家的威望，就上书请求治罪。西魏文帝元宝炬交尚书讨论。七兵尚书、陈郡王元玄等商议认为“边将督军，恭行上天之赏罚;军队被歼而至大败，国法不会放过。荆州刺史独孤如愿，身当重任，远袭襄、宛，斩杀敌军主帅辛纂，传示其首级于京师，论功应当赏赐。

可惜他功绩未能善始善终，迅即沦落于他国，违背了朝廷的期望。然而他孤军数千，并无后援，贼众我寡，实难自保。皇恩已降，不应再绳之以法。从前秦国宽恕孟明，汉朝赦免李广利，他们后来都能改过立功，名垂青史。拿今天来比拟古人，也有成规可循。

臣等商议，请陛下赦免独孤信的罪过，恢复他原来的职务。”西魏文帝下诏说：“独孤信荆、襄之战，实有大功。既遇强敌，力尽道阻，不肯降贼，还朝无路，权宜之计，不足为错。避难江南，履顺入险，情义始终，实可赞叹。况且谦虚退让，诚心谢罪，如果只商议降恩免罪，则不合随势而宜、变通事理之道。可转任骠骑大将军，加侍中、开府衔，其使持节、仪同三司、浮阳郡公之官爵旧。”

抚慰三荆

不久任领军。随从宇文泰收复弘农，攻克沙苑。改封为河内郡公，食邑增加二千户。当时俘虏中有独孤信的亲属，才知道父亲已经去世，于是公告于众，为之服丧守孝。随即被起用为大都督，率军与冯翊王元季海进入洛阳。颍、豫、襄、广、陈留等地相继诚心归附。

大统四年(538年)，东魏将领侯景等人率军围攻洛阳。独孤信据守金墉城，随着敌军的进攻方向予以抵御，坚持了十几天，等到宇文泰抵达瀍水东岸，侯景等人才撤军。独孤信与李远为右军，作战失利，东魏攻占洛阳。大统六年(540年)，侯景侵犯荆州，宇文泰命令独孤信与李弼从武关出兵。侯景撤军后，任命独孤信为大使，抚慰三荆。

赐名平叛

不久，任陇右十州大都督、秦州刺史。起初，地方官员昏庸懦弱，政令悖谬，百姓有冤上诉，多年不能裁定。独孤信到秦州后，公事再无积压。他以礼义教化百姓，劝他们耕田养蚕，过了几年，公私两家都富足起来，流离的百姓有数万家自愿归附。由于他诚信之名远近皆知，所以宇文泰赐名为“信”。

大统七年(541年)，岷州刺史、赤水蕃王梁仚定起兵反叛，诏令独孤信前去征讨。不久，梁仚定被其部下杀死，梁仚定的子弟又收编其残余部众。独孤信就率兵奔向万年，驻兵三交口。贼众全力拒守，独孤信乘机从一条隐秘的小道进军稠松岭。

贼众没有料到独孤信军队从这里打来，一看势头不对，便溃逃而去。独孤信乘胜追击，直达城下，贼众出城投降。加授太子太保。邙山之战时，大军失利。独孤信和于谨收集散兵从后面袭击，惊扰了东魏高欢追击的骑兵，各路兵马因此得以保全。

大统十二年(546年)，凉州刺史宇文仲和占据州城不愿去职，宇文泰命令独孤信率领开府怡峰前去征讨。宇文仲和环城固守。夜里，独孤信命令诸将用冲梯进攻东北角，他亲自率领壮士袭击西南角，天明时将城攻克，活捉宇文仲和，俘虏百姓六千户，全都解送到长安。授为大司马。大统十三年(547年)，大军东征。当时因与柔然为敌，令独孤信移守河阳。

被逼自尽

大统十四年(548年)，升任柱国大将军，总括攻克下溠、保卫洛阳、占领岷州、平定凉州等战功，增加封爵，听任他转授儿子们。于是，次子独孤善封魏宁县公，三子独孤穆封文侯县侯，四子独孤藏封义宁县侯，各食邑一千户;五子独孤顺封项城县伯，六子独孤陀封建忠县伯，食邑各五百户。

独孤信在陇山以西多年，请求回朝，宇文泰不答应。有人从东魏来，又告诉他母亲去世的消息，独孤信公告于众，服丧守孝。当时西魏太子元钦与宇文泰巡视北部边境，顺便到河阳慰问独孤信。独孤信陈述哀苦之情，请求为母亲服满三年之丧，又不被允许。

追赠独孤信之父库者为司空公，追封独孤信之母费连氏为常山郡君。大统十六年(550年)，西魏大军东讨，独孤信率领陇山以西数万人随军，到崤坂而回。升任尚书令。六官建立后，任大司马。

西魏恭帝三年(556年)，西魏恭帝拓跋廓被迫禅位于宇文泰之子宇文觉。宇文觉即位，建立北周，是为孝闵帝，升任独孤信为太保、大宗伯，晋封卫国公，食邑一万户。赵贵被处死后，独孤信以同谋罪被免职。家居不久，晋公宇文护又想杀掉他。由于独孤信一向很有名望，宇文护不打算公开他的罪过，就逼迫他在家自尽，独孤信时年五十五岁。