侯景见巴陵城久攻不下，大将又被擒，只得烧营夜遁。王僧辩在取得巴陵城守卫战胜利后，带军乘胜沿江东下进攻侯景，很快收复江州和郢州，并直指建康，在建康城外，王僧辩与陈霸先军队汇合联营进逼侯景。侯景带军出战，与王陈联军大战于建康城北。联军又兵分两路，派强弩2000张进攻石头城西，很快攻陷石头城，并入居台城。

侯景战败东奔，与心腹数十人乘船逃往海上，其党徒有的投降, 有的北奔，建康复归梁军。逃往海上的侯景被其部下杀死，给江南人民带来灾难的侯景之乱最终被平息。战后，萧绎即帝位，是为梁元帝。王僧辩因功被封为司徒、侍中、尚书令，永宁郡公，食邑5000户。侯景之乱被平定不久，湘州境内又发生叛乱。陆纳等攻破衡州刺史丁道贵，尽收其军资，李洪雅等也率众响应陆纳，梁内乱又起。

萧绎急派王僧辩、陈霸先分任东西都督，带军平叛。最初，王僧辩畏于叛军士卒骁猛，不敢轻进，只是联城进逼，后乘叛军无防备之机，指挥水陆两路军进攻，将叛军逼到长沙城内，湘州叛乱很快被平息。王僧辩带军回镇建康。 在平定侯景之乱前，梁元帝萧绎曾向西魏称臣，既称帝便不再称臣，并要求西魏归还所侵占去的梁、益等州和襄阳等地。

当时，西魏的实权掌握在大臣宇文泰手中，他在据襄阳的萧詧的请求下，派军进袭江陵。城破后，梁元帝被执处死。江陵城破后，王僧辩、陈霸先在建康拥立梁元帝子萧方智为帝，是为梁敬帝，王僧辩以拥立之功被任命为骠骑大将军、中书监、都督中外诸军事，录尚书事。