同治八年七月，在慈禧太后的默许下，安德海借皇上大婚、采办龙袍的名义，乘楼船沿运河南下。按清朝祖制：太监不准出京。但安德海不仅出京，而且一路招摇，惊扰地方。所过顺天府衙门、直隶总督衙门，都隐忍不发。结果在山东被丁宝桢查拿，并以太监出京违背祖制请旨处置。时逢慈禧生病，慈安独处朝政。于是慈安明确表态，同意将安德海就地正法。

这一举动，使慈禧丧失了心腹，又大丢颜面、有苦难言，由此心生嫉恨确属正常。但如果说慈禧嫉恨有人杀了她的心腹太监，那么最要害的人物应该是丁宝桢。慈禧应该整治甚而杀了他以解心头之恨才对。然而，丁宝桢并未因此而丢官，而是屡有升迁，颇受重视。对此，一个比较合理的解释就是：在朝政的大局面前，慈禧具备令朝野上下信服的公正。待丁宝桢尚且如此，她又有何理由杀慈安呢?

另一件是慈安与同治帝违背慈禧选后懿旨，一致坚持选慈禧并不看好的阿鲁特氏为皇后。慈安和同治帝在选后问题上与慈禧的意见有分歧，这对嗜权如命、颐指气使的慈禧来说无疑是空前的打击，她无法原谅自己的亲生儿子在这个关键的时候与慈安联盟背叛自己的旨意;她也十分嫉妒慈安在儿子的心目中拥有比她更为尊崇的地位。

她将这一切痛苦转嫁到阿鲁特氏身上，用变相折磨皇后的手段来表达自己的不满。同治帝死后，慈禧立嗣光绪帝，进一步将皇后阿鲁特氏置于难堪的境地，这一切都让阿鲁特氏感到不寒而栗，又不敢有所申言抗辩，死亡是她唯一的出路。伴随着嘉顺皇后的死，慈禧郁积心中多年的不悦也就渐渐舒解，二次垂帘后，慈禧风光无限，一切朝政得心应手，她没有任何理由依然为此怀恨慈安，动起杀心。

于是产生一种传说，慈安是被慈禧害死的。慈禧害了一场大病，据说是患“蓐(rù)劳”，医生薛福辰“说假病，下真方”，用补药，效果好。慈禧病愈，慈安知道慈禧失德，仍置酒感悟她。慈安保存着咸丰临终前给她的手谕——这份手谕的内容是，如果慈禧跋扈，就用此谕诛之。慈安把这份手谕给慈禧看了，慈禧既惊讶又感动。慈安当着慈禧的面把这份手谕烧了。

数日之后，慈禧请慈安到自己所在的长春宫，并拿出点心招待。慈光绪之宝安有午睡醒后吃点心的习惯，就吃了点心，连说“好，好!”慈禧说这是她娘家送来的。过了几天，慈禧派人送点心给慈安，点心里放了毒药。慈安吃了慈禧派人送来的点心后，腹痛恶心，遽然死去，年45岁。

慈安死后，没等娘家人来就入殓，更加引起人们的猜疑。当时慈禧得的什么病?慈禧是否害死慈安?慈安是否保存手谕?宫廷诡秘，没有证据。这正给影视创作留下想像的空间，也是学者难以解开的历史之谜。慈安病死之后，慈禧独掌大权。