脱脱复相后，慨然以天下为己任，下决心治理这疮痍满目的社会。当时摆在脱脱面前的有几大棘手的难题：

第一、河患引起的严重财政危机。

脱脱辞相后仅一个月，即至正四年夏五月，大雨二十余日，黄河暴溢，水平地深二丈许，北决白茅堤(今河南兰考东北)。六月，又北决金堤。沿河郡邑，如济宁路(治今山东巨野)、曹州(今山东菏泽)、大名路(治今河北大名南)、东平路(治今山东东平)等所属沿河州县均遭水患。

元廷对之束手无策，以致水势不断北浸，到至正八年正月，河水又决，先是淹没济宁路诸地;继而“北侵安山，沦入运河，延袤济南、河间，将隳两漕司盐场，实妨国计”(《元史·贾鲁传》)，大有掐断元王朝经济命脉之势。运河中断将危及大都粮食和生活必需品的供应;水浸河间、山东两盐运司所属盐场，将会使元廷财政收入急遽减少。本来已经空虚的国库面临着新的危机。

第二、河患加剧了社会动荡不安。

自从河患发生以来，河泛区的饥民和流民纷纷起来反抗，有的劫夺商旅，有的打击官府，所在有司无可奈何。全国各地不断爆发起义;至正四年七月，山东私盐贩郭火你赤起义，活动于鲁、晋、豫一带;六年六月，福建汀州连城县罗天麟、陈积万起义，湖南爆发吴天保领导的瑶民起义。

七年十月，全国发生起义达二百余起;八年春，台州黄岩(今属浙江)盐贩方国珍起兵反元;同年三月，辽东锁火奴和辽阳兀颜鲁欢分别自称“大金子孙”，起兵反元;九年，冀宁(今山西太原)平遥等县有曹七七起义;十年，江西铅山、真州(今江苏仪征)、泰州(今属江苏)均有农民起义。