汉兴平元年(194年)，马腾因有一己私欲而有求于 李傕，没有得到应允，于是率兵攻打李傕。 汉献帝派使者去劝解，但双方都没有理会，随后屯于 金城的韩遂率兵前来劝解，然而却与马腾联合，一起进攻李傕。双方于长平观长开交战，马、韩兵败退回凉州。马超已年满十八，已然符合领军作战的年龄标准。是否参与该战斗有待考证。

汉 兴平二年(195年)，马腾上表称军队补给不足，请求在 池阳屯兵食谷，得到朝廷允许后，马腾率军改屯长平岸头。三辅动乱，马超领兵攻破苏氏坞，掠夺苏氏坞的马匹等充军资。

东汉建安元年(196年)，马腾和韩遂因为部下一些小摩擦导致原本称兄道弟的两人互相征伐。此役中，刚满20岁的马超随父亲领兵与韩遂交战。此时的马超已经在号为“天下强勇”的凉州军中，被称作“健勇”。

韩遂军营中的同样有被称为”健勇“的 阎行，阎行在战场交战时，遇到马超，试图用矛刺马超，矛却折断了，接着阎行用断矛击打马超脖子，几乎杀死马超。(此事载于民间私撰《魏略》)