一切准备就绪，正好逢上皇帝大病初愈，朝中文武大臣都集会于未央殿，恭贺天子龙体康复。

吕布借此机会，事先安排同郡骑都尉李肃等人带领十多名亲兵，换上卫士的装束隐蔽在宫殿侧门的两边。

董卓刚到侧门，便遭到李肃等人的突袭。董卓大骇，慌忙向吕布呼救。

吕布正襟危坐，大声道：“我们是奏诏讨杀乱臣贼子，你死有余辜!”绝望中的董卓虽然奋力反抗，但已无济于事，当场被杀，并诛连三族。

董卓被杀后，满朝文武和所有士兵都高呼万岁!长安老百姓高兴得在大街小巷载歌载舞，共同庆祝国贼被诛。

据说董卓死后，被暴尸东市，守尸吏把点燃的捻子插入董卓的肚脐眼中，点起天灯。因为董卓肥胖脂厚，“光明达曙，如是积日”。

董卓死后，凉州军余部由李傕、郭汜等人率领，一个月后，长安被凉州军攻破。