翠屏山对质

于是石秀就先杀了探路的胡道，随后用胡道的木鱼声引出裴如海，把他也给杀了，然后将尸体剥光扔在马路上。杨雄心知肚明这是石秀干的，也猜到石秀说的基本是事实。

于是杨雄向石秀道歉，并把巧云弄到翠屏山去质问清楚，杨雄将巧云和帮她安排通奸的使女迎儿给杀了。

投奔梁山

正当杨雄、石秀杀了潘巧云后商量上梁山时，时迁正好在一旁目击了全部过程，时迁要求同上梁山。于是三人同上梁山。

三打祝家庄

石秀三人投奔梁山时，途径祝家庄，这个时迁贼心不改，偷了人家店里报晓的公鸡吃了，结果时迁被抓。

石秀，杨雄逃出后遇见杜兴，杨雄有恩于杜兴，于是杜兴向主人李应求情救时迁，李应爽快答应了，但祝家庄不肯放人，反而射伤李应，石秀于是上梁山求助于宋江，于是宋江决定攻打祝家庄。

祝家庄道路难走，于是宋江派石秀杨林探路，石秀不仅成功地从钟离老人那里探明了盘陀路的机关，而且还帮助陷入迷宫的宋江突围。显示了超强的情报工作能力。

不久石秀又假败、甘愿被卧底的孙立俘虏到祝家庄当内应，石秀为打破祝家庄立下了大功，从而也在梁山站稳了脚跟。[7]

独劫法场

石秀、杨雄被派往大名府打探情况。燕青此时救下了卢俊义，但卢俊义还是被后面追捕的人抓走了。

这时候，石、杨两人遇上燕青，当场决定杨雄同燕青回梁山求救，而石秀继续前往大名府关注事态的发展。

当石秀赶到大名府时，梁中书怕夜长梦多，决定将卢俊义立即就地正法。正当蔡福举刀行刑的千钧一发之际，石秀当机立断，孤身一人劫了法场。

石秀人单势孤，虽然将卢俊义劫出法场，仍未能成功逃离大名府，结果自己也被逮捕。[8] 后来大名府被攻破，石秀也自然获救。

惨烈结局

石秀在招安前对抗童贯、高俅的战争以及受招安后征辽、征田虎、王庆的战争中立下战功，最后在征方腊时，在昱岭关被乱箭射死。

这一部分的内容，视版本的不同，有所差异，主要是在起源更早的百回本里无田虎、王庆情节，经过“腰斩”并增加“惊噩梦”情节的金圣叹评本无大聚义以后情节，而征田虎、王庆的具体过程在不同版本中也有所不同。