儿子

宪怀太子朱翊釴：母裕王妃李氏，五岁殇，赠裕世子。明穆宗隆庆元(1567)年，追封谥“宪怀太子”。

靖悼王朱翊铃：未满周岁殇，赠蓝田王。明穆宗隆庆元(1567)年，追封谥“靖悼王”。

明神宗朱翊钧：母李贵妃，明穆宗隆庆二(1568)年册为太子。

潞简王朱翊镠：母李贵妃，明穆宗隆庆六(1568)年封“潞王”，明神宗万历四十二(1614)年薨，谥“简”。

女儿

蓬莱公主，早薨，明穆宗隆庆元(1567)年追封“蓬莱公主”

太和公主，早薨，明穆宗隆庆元(1567)年追封。

寿阳公主朱尧娥，明神宗万历九(1581)年，下嫁侯拱辰。

永宁公主朱尧媖，下嫁梁邦瑞，明神宗万历三十五(1607)年薨。

瑞安公主朱尧媛，孝定太后李氏女，万历十三年下嫁万炜。

延庆公主朱尧姬，万历十五年下嫁王昺。

栖霞公主朱尧姜，母淑妃秦氏。隆庆五年七月生。隆庆六年九月薨。