李显当了皇帝后，昏聩立现，以为自己就是权力无限的至尊天子，完全忘了身后还有一个铁血老娘。即位不久，便将韦氏的父亲韦玄贞，从普州参军提拔到豫州剌史，过不了几天，又要拔擢为侍中;还要给自己乳母的儿子授五品官，宰相裴炎不同意这种无功受禄的做法。

乍当皇帝的李显，感到皇权受到了挑战，恼羞成怒，大声喝斥道：“我便将天下送给韦玄贞，又有何不可，何况一个侍中?”裴炎不敢辩驳，便将情况报告给武则天。武则天大惊，没想到往日平庸懦弱的儿子，居然为了韦氏生出这么大的胆子。

698年，武则天重新把李显接回长安，重新立他为皇太子。705年，武则天病重，张柬之等人趁机发动神龙政变，迫使武则天传位于李显。于是李显第二次登基，并复国号为唐。李显复位后，又立韦氏为皇后，让她能参与朝政，又封韦后父亲为王，而韦后又和武三思苟且，又信用武三思，并且结成了一股强大的政治势力左右着朝政，李显对此却毫无办法，这才为后面酿下了祸根。

《全唐史》记载的比较全面，710年，有一个地方小官叫燕钦融，他上书指责韦皇后淫乱并且干预朝政，唐中宗觉得这种丢人的事情都传到小地方去了，自己很没面子，于是就把这个人召来问话，可是韦后让他的亲信当众将燕钦融摔死!这样无法无天，中宗看了当然很生气，但是他还是怕韦皇后的，虽然心里有怒气，但还是没有追究韦皇后。

事后，韦皇后怕李显追查她犯的种种奸淫之事，而韦皇后和中宗的女儿安乐公主也喜欢自己的母亲能效仿武则天称帝，自己就可以当皇太女了。于是母女两就开始商量对策准备谋害唐中宗。唐中宗喜欢吃饼，韦皇后就让他的情夫马秦客人配置了毒药，然后把毒药混入饼中，蒸熟后，命宫女送入神龙殿。这个时候李显正在批阅奏章，看到送来的饼，随手取来就吃了。

不一会儿，他的肚子痛如刀绞，卧倒在床上乱滚，身边的太监见状，立马去报告韦皇后。可是韦皇后却磨磨蹭蹭，故意拖延时间，过了好一会儿才赶到，还假惺惺的问中宗怎么。只是当时中宗痛的根本说不出话，只能哭泣，过了没多久就死了。